Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl11Q9CQF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms