Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rpl39lQ9CQD0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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