Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CQC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CQC3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9CQC3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9CQC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQC3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQC3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms