Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd1Q9CQA6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms