Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms