Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt88Q9CPR6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt88Q9CPR6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms