Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm3Q9CPP0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm3Q9CPP0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms