Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPN7

1810009J06Rik, RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810009J06RikQ9CPN7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1810009J06RikQ9CPN7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1810009J06RikQ9CPN7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1810009J06RikQ9CPN7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms