Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scd3Q99PL7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scd3Q99PL7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms