Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NsmfQ99NF2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms