Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atoh8Q99NA2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atoh8Q99NA2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms