Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel1Q99MW3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel1Q99MW3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel1Q99MW3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms