Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PtprtQ99M80 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
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