Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gins4Q99LZ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms