Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cds2Q99L43 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms