Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1aQ99L02 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms