Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms