Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emc3Q99KI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Emc3Q99KI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emc3Q99KI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms