Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pacsin3Q99JB8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pacsin3Q99JB8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms