Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddb2Q99J79 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddb2Q99J79 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms