Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Apobec3Q99J72 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec3Q99J72 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec3Q99J72 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms