Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CsprsQ99388 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms