Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn4Q925N1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn4Q925N1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn4Q925N1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfxn4Q925N1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn4Q925N1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms