Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Letmd1Q924L1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Letmd1Q924L1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms