Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim7Q923T7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim7Q923T7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms