Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4bQ91ZR1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4bQ91ZR1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4bQ91ZR1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4bQ91ZR1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4bQ91ZR1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4bQ91ZR1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4bQ91ZR1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4bQ91ZR1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4bQ91ZR1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4bQ91ZR1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab4bQ91ZR1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4bQ91ZR1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4bQ91ZR1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4bQ91ZR1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4bQ91ZR1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4bQ91ZR1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms