Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pde6cQ91ZQ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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