Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp3Q91W36 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp3Q91W36 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms