Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf4Q8VI88 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms