Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Crb1Q8VHS2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crb1Q8VHS2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crb1Q8VHS2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms