Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps4aQ8VEJ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps4aQ8VEJ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms