Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Itgbl1Q8VDV0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgbl1Q8VDV0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgbl1Q8VDV0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms