Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sft2d2Q8VD57 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d2Q8VD57 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms