Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms