Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh10Q8VCH7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh10Q8VCH7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh10Q8VCH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh10Q8VCH7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh10Q8VCH7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh10Q8VCH7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh10Q8VCH7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rdh10Q8VCH7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh10Q8VCH7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh10Q8VCH7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms