Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sumf1Q8R0F3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sumf1Q8R0F3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms