Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pof1bQ8K4L4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pof1bQ8K4L4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms