Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ncapd2Q8K2Z4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ncapd2Q8K2Z4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd2Q8K2Z4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms