Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl47Q8K2Y7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl47Q8K2Y7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms