Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Paf1Q8K2T8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Paf1Q8K2T8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms