Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc12Q8K2L8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms