Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek9Q8K1R7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek9Q8K1R7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms