Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZU6

Pxdc1, PX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pxdc1Q8JZU6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pxdc1Q8JZU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pxdc1Q8JZU6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pxdc1Q8JZU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pxdc1Q8JZU6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pxdc1Q8JZU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms