Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20aQ8CID3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam20aQ8CID3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms