Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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