Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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