Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf31Q8CCF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf31Q8CCF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms