Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm16223Q8CBM3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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