Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nrip1Q8CBD1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip1Q8CBD1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1179.1 ms