Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn3Q8CBC6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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